Wir blicken in der heutigen Folge nochmal auf Themen aus vorangegangenen Episoden zurück. Wir greifen da im Speziellen die Malariabekämpfung und das Anthropozän nochmal auf. Bei den Wissenschaftsnachrichten haben wir diesmal aktuelle Publikationen und Neuigkeiten aus den Fachbereichen Sprach- & Kulturforschung, Paläontologie, Materialforschung zum Thema Graphen, Medizin/Immunologie und eine Studie zur Gesundheit von Honigbienen im Gepäck. Im Anschluss gibt Katrin noch Einblicke in ihre Sichtweise auf die Bioinformatik: die Tücken des wissenschaftlichen Alltags und das digitale Laborjournal. Und weil das hier eine Geburtstagsfolge ist, gibt es Kuchen. Naja, ohne Boden. Viel Spaß beim Hören!
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Sendungsnotizen
Notizen & Links
Geburtstagssendung! 2 Monate, 5 Folgen :-)
Zusatz zur Sendung KNS001
Zusatz zur Sendung KNS003
- noch ‘ne Malaria-Bekämpfungsstrategie: weibl. Moskitos mit Wolbachia-Bakterien infizieren, damit sie selbst immun gegen Plasmodien werden (Science)
- Wolbachia-Infektion wird dominant ererbt, aber nur von weibl. Mücken
- Problem: Anopheles-Stamm mit reproduzierbarer Übertragung finden => Infektion ließ viele Eier absterben
- Ausbreitung auf gesamte Population innerhalb einiger Wochen
- Wirkmechanismus nicht vollst. aufgeklärt
- vermutlich via Aktivierung des Immunsystems => freie Radikale gegen nicht-bakterielle Parasiten
- Wolbachia kann sich parasitisch & symbiotisch verhalten
- erfolgreiche Feldversuche gegen Dengue-Viren in Austrialien (Nature)
- Wolbachia-Infektion wird dominant ererbt, aber nur von weibl. Mücken
Wissenschaftsnachrichten
Kulturelle Phylogeographie von Sprache
- Thomas E. Currie, Andrew Meade, Myrtille Guillon, and Ruth Mace Cultural phylogeography of the Bantu Languages of sub-Saharan Africa Proc R Soc B 2013 280: 20130695
- Bantu: Eine Sprachfamilie mit > 500 Sprachen in Subsahara-Afrika
- Vielfalt stammt von einer Völkerwanderung vor 3000-5000 Jahren
- Die Völkerwanderung war ein Motor kultureller Innovation, die genaue Route jedoch ist nicht geklärt
- Die Entwicklung des Bantu wurde nun zur Untersuchung der Völkerwanderung eingesetzt mittels phylogeografischer Methoden
- Die Ergebnisse decken sich relativ genau mit einer der bestehenden Hypothesen, der “pathway through the rainforest”
Atlas der Vertebraten-Verwesung
- Sansom, R. S., Gabbott, S. E., Purnell, M. A. (2013), Atlas of vertebrate decay: a visual and taphonomic guide to fossil interpretation. Palaeontology, 56: 457–474
- Was tut man, wenn man sich für solche Fossilstrukturen interessiert, die sich durch Verwesung stark verändern?
- Ein Forscherteam hat sich die Verwesungsprozesse eben solcher Strukturen in extanten Referenzorganismen angesehen und einen Atlas dazu erstellt
- Damit lassen sich Fossilien an der Schwelle zu den Wirbeltieren neu deuten
Honigbienen, die mit Honigersatzlösung gefüttert werden, haben geschwächtes Immunsystem
- Hochleistungsimkerei: Honig wir vollst. geerntet, Bienen wird Zuckerwasser mit Honigersatzstoffen gegeben
- senkt Transkription von Genen, die Entgiftungsenzyme produzieren => Schwächung des Immunsystem => Anfälligkeit für Pestizide & Parasiten steigt steigt
Zwei coole Nachrichten über Graphen
- Graphen: absolut plane Gitterstruktur aus C-Atomen: dünn, stark, super-leitfähig
- Neuheit I: Bunte Laser?
- Die ungebundenen Elektronen des Graphens können viele unterschiedliche Energie-Zustände einnehmen , und daurch Licht über ein ganzes Spektrum von Wellenlängen absorbieren
- Graphen ist eines der wenigen Materialien, die auch im Infrarot-Bereich absorbieren
- Damit ist es interessant für den Bau neuartiger Laser
- Neuheit II: rasante Elektronik & Quantum Computing
- 2005 gezeigt: freie Elektronen von Graphen sind so schnell, dass sie quasi masse-frei sind und auf Lichtgeschwindigkeit über das Material sausen können
- Haben Graphen-ähnliche Materialien ähnliche oder gar bessere Eigenschaften?
- Mehrere Arbeitsgruppen haben Wege gefunden, die Eigenschaften des Graphens zu kopieren oder gar zu verbessern
- Durch Manipulation dieser Strukturen lassen sich neue Eigenschaften entdecken
- Die Hoffnung: topologische Isolatoren und Majorana-Fermionen, die für Quantum Computing einsetzbar wären
- Rastertunnelmikroskopie-Video
Universelle Grippe-Impfung in Sicht
- Das Problem bei Grippe: Der Virus unterliegt schneller Veränderung, der Impfstoff muss jedes Jahr neu entwickelt werden
- Eine neue Art Impfstoff bietet besseren Schutz gegenüber gleich mehreren Stämmen
- synthetische, selbstassemblierende Nanopartikel aus Virusproteinen und Ferritin
- Mögliche Impfstoffe gegen HI- und Herpes-Viren werden gerade nach dem gleichen Prinzip entwickelt
Anthropozän
- geologisches Zeitalter, in dem der Mensch viele Aspekter der Erde in einem Umfang beeinflusst, der denen von Naturgewalten ähnelt
- Ökosysteme, geo-chemische Zyklen von z.B. CO2 & anorg. Nährstoffen, Wetter, Klima, geologische Formationen
- stratigraphische und geochronologische Einteilung der Erdgeschicht definiert durch Internationale Kommission für Stratigraphie
- seit letzter Eiszeit: Epoche des Holozäns
- Vorschlag/Diskussion: neue Epoche “Anthropozän” definieren; Beginn unklar
- Beispiel: Ozonloch (Nature PastCast; Nature Themenseite)
- Theorie: durch Menschen emittierte FCKWs reagieren in hohen Atmosphärenschichten Ozon ab
- Entdeckung (1985): Ozonloch über der Antarktis; viel geringere O3-Konz. als befürchtet (Software auf ignore gestellt => hätte früher entdeckt werden können)
- Montreal-Protokoll (1989): Vorbild für globale Umweltschutzanstrengungen
- kleineres Ozonloch auch über Arktis entdeckt (Winter 2010/11)
- Regeneration der O3-Schicht vermutlich bis Mitte dieses Jhd.
- “Eltern haften für ihre Kinder” => “Menschheit haftet für ihren Planeten”
- weiterer Hörstoff: “This American Life”-Episode über Klimawandelwahrnehmung in den USA seit 2012
- weiterer Lesestoff: Welcome to the anthropocene, aktuelle Literatur bei Elsevier, Wikipedia
Laberecke
- Informatik in der Biologie heißt oft nocht: MS Office Dokumente per E-Mail hin-und-herzuschicken
- Probleme: maßgeschneiderte Software oft zu kompliziert, einfache Software reicht oft für Grundlagen => Word für Sequenzdaten
- Pflegen von Gerätesteuerungssoftware ist oft kein Geschäftsmodell
- Interview im Science Podcast dazu
- Optimismus: Etherpads, Google Docs usw. akzeptiert, wenn Vorteile demonstriert
- Katrin macht Laborjournal in digital (eigene Präsentation dazu)
- generelle Vorteile: Volltextsuche, verlinken, teilen
- Rizzoma für Protokolle, chronologische Liste der Arbeitsschritte, Beobachtungen, Notizen
- Problem mit chronologischer Auflistung: parallele Projekte werden unübersichtlich
- mögliche Lösung: Projekte, Arbeitsschritte, Ergebnisse etc. hierarchisch verschachteln
- Google Spreadsheets für erste Bearbeitung der Rohdaten
- will zu Trello wechseln: Karte = Protokoll; Beobachtungen, chronologische Arbeitsliste und Notizen als Kommentare zur Karte
- ownCloud & BitTorrent Sync schieben Fotos & Daten auf Arbeitsrechner
Studentenfutter
- Welchen Kuchen wir auch immer gerade live essen, und Gruss an Annelise
- selbst gemachter Matetee (siehe Rezept) schmeckt lecker; Matecalypse überlebt!